Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NEDD9Q14511 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD9Q14511 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD9Q14511 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD9Q14511 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD9Q14511 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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