Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NEDD9Q14511 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEDD9Q14511 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEDD9Q14511 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEDD9Q14511 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEDD9Q14511 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEDD9Q14511 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NEDD9Q14511 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEDD9Q14511 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEDD9Q14511 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEDD9Q14511 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEDD9Q14511 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEDD9Q14511 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEDD9Q14511 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEDD9Q14511 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEDD9Q14511 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEDD9Q14511 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEDD9Q14511 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEDD9Q14511 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NEDD9Q14511 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEDD9Q14511 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEDD9Q14511 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEDD9Q14511 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NEDD9Q14511 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEDD9Q14511 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEDD9Q14511 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEDD9Q14511 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEDD9Q14511 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEDD9Q14511 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEDD9Q14511 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEDD9Q14511 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEDD9Q14511 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEDD9Q14511 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEDD9Q14511 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEDD9Q14511 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEDD9Q14511 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEDD9Q14511 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEDD9Q14511 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NEDD9Q14511 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEDD9Q14511 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEDD9Q14511 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEDD9Q14511 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEDD9Q14511 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEDD9Q14511 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NEDD9Q14511 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NEDD9Q14511 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEDD9Q14511 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEDD9Q14511 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEDD9Q14511 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEDD9Q14511 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEDD9Q14511 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEDD9Q14511 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEDD9Q14511 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEDD9Q14511 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEDD9Q14511 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEDD9Q14511 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEDD9Q14511 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEDD9Q14511 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NEDD9Q14511 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NEDD9Q14511 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEDD9Q14511 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEDD9Q14511 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEDD9Q14511 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEDD9Q14511 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEDD9Q14511 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEDD9Q14511 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEDD9Q14511 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NEDD9Q14511 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NEDD9Q14511 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEDD9Q14511 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEDD9Q14511 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NEDD9Q14511 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEDD9Q14511 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEDD9Q14511 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEDD9Q14511 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEDD9Q14511 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEDD9Q14511 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEDD9Q14511 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEDD9Q14511 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEDD9Q14511 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEDD9Q14511 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEDD9Q14511 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEDD9Q14511 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEDD9Q14511 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEDD9Q14511 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEDD9Q14511 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEDD9Q14511 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEDD9Q14511 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEDD9Q14511 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEDD9Q14511 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEDD9Q14511 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEDD9Q14511 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEDD9Q14511 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEDD9Q14511 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NEDD9Q14511 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEDD9Q14511 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEDD9Q14511 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEDD9Q14511 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEDD9Q14511 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEDD9Q14511 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
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