Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PKP1Q13835 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKP1Q13835 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKP1Q13835 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
PKP1Q13835 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKP1Q13835 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
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