Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PKP1Q13835 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKP1Q13835 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PKP1Q13835 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PKP1Q13835 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PKP1Q13835 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PKP1Q13835 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PKP1Q13835 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PKP1Q13835 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PKP1Q13835 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PKP1Q13835 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PKP1Q13835 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKP1Q13835 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PKP1Q13835 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PKP1Q13835 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PKP1Q13835 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PKP1Q13835 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PKP1Q13835 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PKP1Q13835 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PKP1Q13835 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKP1Q13835 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKP1Q13835 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PKP1Q13835 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PKP1Q13835 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKP1Q13835 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PKP1Q13835 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKP1Q13835 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKP1Q13835 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PKP1Q13835 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PKP1Q13835 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PKP1Q13835 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PKP1Q13835 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKP1Q13835 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PKP1Q13835 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKP1Q13835 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKP1Q13835 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKP1Q13835 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKP1Q13835 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKP1Q13835 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKP1Q13835 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKP1Q13835 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKP1Q13835 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PKP1Q13835 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKP1Q13835 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PKP1Q13835 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PKP1Q13835 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKP1Q13835 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKP1Q13835 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKP1Q13835 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKP1Q13835 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PKP1Q13835 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKP1Q13835 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PKP1Q13835 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PKP1Q13835 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PKP1Q13835 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKP1Q13835 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKP1Q13835 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKP1Q13835 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PKP1Q13835 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKP1Q13835 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKP1Q13835 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKP1Q13835 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PKP1Q13835 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PKP1Q13835 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKP1Q13835 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKP1Q13835 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKP1Q13835 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKP1Q13835 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKP1Q13835 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PKP1Q13835 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PKP1Q13835 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKP1Q13835 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PKP1Q13835 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKP1Q13835 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PKP1Q13835 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKP1Q13835 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PKP1Q13835 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKP1Q13835 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKP1Q13835 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PKP1Q13835 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PKP1Q13835 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKP1Q13835 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKP1Q13835 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKP1Q13835 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKP1Q13835 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKP1Q13835 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PKP1Q13835 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PKP1Q13835 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PKP1Q13835 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKP1Q13835 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKP1Q13835 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKP1Q13835 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKP1Q13835 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PKP1Q13835 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKP1Q13835 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms