Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUL4BQ13620 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL4BQ13620 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL4BQ13620 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CUL4BQ13620 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4BQ13620 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CUL4BQ13620 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CUL4BQ13620 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
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