Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ABHD4-207ENST00000541962 662 ntTSL 517.1■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 516.64■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 416.53■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-209ENST00000544562 929 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-205ENST00000537243 550 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-202ENST00000418446 1003 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-220ENST00000580617 1352 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 210.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-212ENST00000464381 2474 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-210ENST00000545034 185 ntTSL 59.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-214ENST00000470782 3987 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -11e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 38.52□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 27.33□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ERO1A-208ENST00000556358 951 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ERO1A-209ENST00000556769 934 ntTSL 54.45□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.165e-9■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.75■■□□□ 1.395e-9■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 DDX54-207ENST00000550016 594 ntTSL 524.01■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SF3B2-210ENST00000530981 1080 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 FTSJ3-213ENST00000583901 867 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 FTSJ3-212ENST00000583202 908 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 PRPF8-214ENST00000576585 2157 ntTSL 215.31■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-204ENST00000577901 917 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-209ENST00000585042 567 ntTSL 418.52■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-207ENST00000583879 719 ntTSL 26.54□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 32.55□□□□□ -22e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 TRRAP-206ENST00000480695 805 ntTSL 414.59□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 427.59■■■□□ 2.012e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 524.37■■□□□ 1.493e-7■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 NUP93-208ENST00000563858 797 ntTSL 519.76■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 ALDH18A1-204ENST00000485428 726 ntTSL 210.96□□□□□ -0.655e-9■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 FTSJ3-204ENST00000579831 411 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.084e-20■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PKM-213ENST00000564993 663 ntTSL 214.13□□□□□ -0.158e-20■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 LDHA-208ENST00000469976 656 ntTSL 213.64□□□□□ -0.236e-39■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 CCT8-205ENST00000475205 431 ntTSL 28.43□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-202ENST00000371720 713 ntTSL 426.42■■□□□ 1.823e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-212ENST00000622209 1013 ntTSL 1 (best)26.04■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-207ENST00000612553 1174 ntTSL 225.6■■□□□ 1.693e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-206ENST00000610649 756 ntTSL 59.26□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt18.8■□□□□ 0.63e-13■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.443e-13■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-218ENST00000491494 371 ntTSL 221.12■□□□□ 0.979e-8■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 221.08■□□□□ 0.973e-9■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-202ENST00000416465 612 ntTSL 522.62■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-203ENST00000433341 808 ntTSL 38.76□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 216.52■□□□□ 0.238e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 225.35■■□□□ 1.653e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 220.61■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.853e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 219.6■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ETNK1-203ENST00000538218 1659 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 317.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.78e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-218ENST00000633485 5863 ntTSL 59.55□□□□□ -0.888e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.928e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.744e-10■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.994e-10■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-228ENST00000534352 573 ntTSL 223.02■■□□□ 1.283e-12■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-210ENST00000509471 575 ntTSL 38.87□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -15e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-208ENST00000506705 1340 ntTSL 58.74□□□□□ -1.015e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PABPC1-221ENST00000522720 593 ntTSL 420.31■□□□□ 0.848e-14■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 DDX54-204ENST00000546898 479 ntTSL 319.67■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-8■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.518e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.088e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ATP5B-206ENST00000550162 863 ntTSL 216.35■□□□□ 0.215e-15■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 358.1 ms