Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPB3Q12988 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPB3Q12988 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSPB3Q12988 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HSPB3Q12988 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms