Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HSPB3Q12988 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HSPB3Q12988 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
HSPB3Q12988 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HSPB3Q12988 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HSPB3Q12988 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HSPB3Q12988 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HSPB3Q12988 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HSPB3Q12988 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HSPB3Q12988 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HSPB3Q12988 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HSPB3Q12988 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HSPB3Q12988 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HSPB3Q12988 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HSPB3Q12988 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HSPB3Q12988 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSPB3Q12988 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSPB3Q12988 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSPB3Q12988 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HSPB3Q12988 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HSPB3Q12988 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSPB3Q12988 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPB3Q12988 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPB3Q12988 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPB3Q12988 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSPB3Q12988 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPB3Q12988 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPB3Q12988 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPB3Q12988 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPB3Q12988 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPB3Q12988 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPB3Q12988 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPB3Q12988 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPB3Q12988 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPB3Q12988 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSPB3Q12988 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPB3Q12988 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPB3Q12988 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSPB3Q12988 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HSPB3Q12988 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HSPB3Q12988 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HSPB3Q12988 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HSPB3Q12988 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSPB3Q12988 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPB3Q12988 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPB3Q12988 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPB3Q12988 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPB3Q12988 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPB3Q12988 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPB3Q12988 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPB3Q12988 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPB3Q12988 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPB3Q12988 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPB3Q12988 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPB3Q12988 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPB3Q12988 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPB3Q12988 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPB3Q12988 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPB3Q12988 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPB3Q12988 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPB3Q12988 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPB3Q12988 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPB3Q12988 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPB3Q12988 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPB3Q12988 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPB3Q12988 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPB3Q12988 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSPB3Q12988 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSPB3Q12988 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSPB3Q12988 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPB3Q12988 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPB3Q12988 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPB3Q12988 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPB3Q12988 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPB3Q12988 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPB3Q12988 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPB3Q12988 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPB3Q12988 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPB3Q12988 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPB3Q12988 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSPB3Q12988 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSPB3Q12988 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HSPB3Q12988 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSPB3Q12988 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSPB3Q12988 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HSPB3Q12988 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSPB3Q12988 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSPB3Q12988 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPB3Q12988 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSPB3Q12988 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPB3Q12988 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPB3Q12988 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPB3Q12988 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPB3Q12988 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
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