Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3Q03167 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR3Q03167 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGFBR3Q03167 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3Q03167 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms