Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAX2Q02962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX2Q02962 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms