Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F1Q01094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F1Q01094 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F1Q01094 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F1Q01094 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms