Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPD1P62314 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPD1P62314 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPD1P62314 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPD1P62314 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPD1P62314 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms