Protein–RNA interactions for Protein: P62195

PSMC5, 26S proteasome regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC5P62195 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC5P62195 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSMC5P62195 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC5P62195 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC5P62195 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC5P62195 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC5P62195 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms