Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN1P60606 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN1P60606 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTXN1P60606 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms