Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB3P49720 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms