Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMB3P49720 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB3P49720 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMB3P49720 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMB3P49720 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMB3P49720 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB3P49720 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB3P49720 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB3P49720 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB3P49720 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB3P49720 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB3P49720 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB3P49720 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB3P49720 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB3P49720 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB3P49720 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB3P49720 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB3P49720 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB3P49720 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB3P49720 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB3P49720 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB3P49720 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB3P49720 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB3P49720 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB3P49720 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB3P49720 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB3P49720 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB3P49720 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB3P49720 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB3P49720 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB3P49720 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB3P49720 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB3P49720 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB3P49720 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB3P49720 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB3P49720 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB3P49720 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB3P49720 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB3P49720 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB3P49720 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB3P49720 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB3P49720 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB3P49720 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB3P49720 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB3P49720 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB3P49720 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB3P49720 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB3P49720 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB3P49720 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB3P49720 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB3P49720 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB3P49720 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB3P49720 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB3P49720 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB3P49720 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB3P49720 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB3P49720 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB3P49720 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB3P49720 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB3P49720 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB3P49720 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB3P49720 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB3P49720 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB3P49720 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB3P49720 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB3P49720 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB3P49720 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB3P49720 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB3P49720 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB3P49720 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB3P49720 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB3P49720 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB3P49720 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB3P49720 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB3P49720 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB3P49720 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB3P49720 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB3P49720 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms