Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARS2P49590 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARS2P49590 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HARS2P49590 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARS2P49590 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARS2P49590 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARS2P49590 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HARS2P49590 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARS2P49590 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARS2P49590 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARS2P49590 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARS2P49590 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARS2P49590 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARS2P49590 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARS2P49590 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARS2P49590 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARS2P49590 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARS2P49590 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARS2P49590 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HARS2P49590 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARS2P49590 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARS2P49590 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARS2P49590 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HARS2P49590 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARS2P49590 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARS2P49590 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARS2P49590 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARS2P49590 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARS2P49590 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARS2P49590 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARS2P49590 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARS2P49590 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARS2P49590 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HARS2P49590 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HARS2P49590 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HARS2P49590 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARS2P49590 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARS2P49590 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARS2P49590 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARS2P49590 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HARS2P49590 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARS2P49590 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARS2P49590 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HARS2P49590 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARS2P49590 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARS2P49590 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HARS2P49590 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARS2P49590 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARS2P49590 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARS2P49590 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARS2P49590 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARS2P49590 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARS2P49590 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HARS2P49590 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARS2P49590 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARS2P49590 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARS2P49590 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARS2P49590 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HARS2P49590 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HARS2P49590 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARS2P49590 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HARS2P49590 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARS2P49590 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARS2P49590 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARS2P49590 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HARS2P49590 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HARS2P49590 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HARS2P49590 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HARS2P49590 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARS2P49590 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HARS2P49590 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HARS2P49590 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARS2P49590 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARS2P49590 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARS2P49590 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HARS2P49590 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms