Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP5P45974 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP5P45974 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP5P45974 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP5P45974 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP5P45974 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP5P45974 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP5P45974 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP5P45974 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP5P45974 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP5P45974 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP5P45974 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP5P45974 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP5P45974 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP5P45974 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP5P45974 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
USP5P45974 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP5P45974 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP5P45974 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP5P45974 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP5P45974 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP5P45974 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP5P45974 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP5P45974 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP5P45974 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP5P45974 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP5P45974 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP5P45974 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP5P45974 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP5P45974 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP5P45974 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP5P45974 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP5P45974 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP5P45974 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP5P45974 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
USP5P45974 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
USP5P45974 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP5P45974 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP5P45974 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP5P45974 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP5P45974 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP5P45974 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP5P45974 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP5P45974 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
USP5P45974 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP5P45974 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP5P45974 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP5P45974 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP5P45974 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP5P45974 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP5P45974 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP5P45974 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP5P45974 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
USP5P45974 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP5P45974 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP5P45974 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP5P45974 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP5P45974 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP5P45974 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP5P45974 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
USP5P45974 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP5P45974 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP5P45974 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP5P45974 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP5P45974 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP5P45974 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP5P45974 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP5P45974 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP5P45974 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP5P45974 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP5P45974 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms