Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGFRP43088 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRP43088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRP43088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms