Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FDFT1P37268 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FDFT1P37268 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FDFT1P37268 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms