Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFBR1P36897 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGFBR1P36897 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR1P36897 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms