Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM23P36406 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM23P36406 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM23P36406 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM23P36406 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms