Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRPAP1P30533 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPAP1P30533 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPAP1P30533 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPAP1P30533 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPAP1P30533 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPAP1P30533 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRPAP1P30533 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPAP1P30533 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRPAP1P30533 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRPAP1P30533 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRPAP1P30533 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRPAP1P30533 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRPAP1P30533 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRPAP1P30533 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRPAP1P30533 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRPAP1P30533 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRPAP1P30533 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRPAP1P30533 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPAP1P30533 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRPAP1P30533 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms