Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA2P26232 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNA2P26232 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA2P26232 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA2P26232 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNNA2P26232 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA2P26232 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA2P26232 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA2P26232 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms