Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN3P20807 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN3P20807 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms