Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP4AP20648 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP4AP20648 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP4AP20648 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP4AP20648 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP4AP20648 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP4AP20648 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms