Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPN1P18031 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN1P18031 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN1P18031 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN1P18031 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms