Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NID1P14543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NID1P14543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NID1P14543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NID1P14543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NID1P14543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NID1P14543 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NID1P14543 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NID1P14543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NID1P14543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NID1P14543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NID1P14543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NID1P14543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NID1P14543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NID1P14543 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NID1P14543 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NID1P14543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NID1P14543 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NID1P14543 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NID1P14543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NID1P14543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NID1P14543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NID1P14543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NID1P14543 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NID1P14543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NID1P14543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NID1P14543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NID1P14543 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NID1P14543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NID1P14543 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NID1P14543 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NID1P14543 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NID1P14543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NID1P14543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NID1P14543 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NID1P14543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NID1P14543 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NID1P14543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NID1P14543 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NID1P14543 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NID1P14543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NID1P14543 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NID1P14543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NID1P14543 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NID1P14543 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NID1P14543 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NID1P14543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NID1P14543 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NID1P14543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NID1P14543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NID1P14543 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NID1P14543 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NID1P14543 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NID1P14543 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NID1P14543 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NID1P14543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NID1P14543 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NID1P14543 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NID1P14543 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NID1P14543 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NID1P14543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NID1P14543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms