Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCSHP14314 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCSHP14314 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCSHP14314 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKCSHP14314 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms