Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYGBP11216 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYGBP11216 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYGBP11216 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYGBP11216 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYGBP11216 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYGBP11216 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYGBP11216 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PYGBP11216 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYGBP11216 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYGBP11216 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYGBP11216 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYGBP11216 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PYGBP11216 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYGBP11216 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYGBP11216 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYGBP11216 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYGBP11216 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PYGBP11216 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYGBP11216 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PYGBP11216 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PYGBP11216 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYGBP11216 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PYGBP11216 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PYGBP11216 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PYGBP11216 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYGBP11216 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYGBP11216 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYGBP11216 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYGBP11216 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PYGBP11216 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PYGBP11216 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PYGBP11216 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PYGBP11216 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYGBP11216 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYGBP11216 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYGBP11216 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PYGBP11216 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PYGBP11216 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PYGBP11216 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYGBP11216 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYGBP11216 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYGBP11216 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PYGBP11216 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PYGBP11216 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PYGBP11216 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PYGBP11216 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYGBP11216 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYGBP11216 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYGBP11216 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYGBP11216 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYGBP11216 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYGBP11216 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYGBP11216 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYGBP11216 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PYGBP11216 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PYGBP11216 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PYGBP11216 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PYGBP11216 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PYGBP11216 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PYGBP11216 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PYGBP11216 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PYGBP11216 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PYGBP11216 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PYGBP11216 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGBP11216 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGBP11216 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGBP11216 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGBP11216 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGBP11216 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGBP11216 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGBP11216 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGBP11216 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGBP11216 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGBP11216 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGBP11216 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGBP11216 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PYGBP11216 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PYGBP11216 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGBP11216 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms