Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM1P09493 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM1P09493 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM1P09493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM1P09493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM1P09493 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TPM1P09493 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TPM1P09493 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM1P09493 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM1P09493 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM1P09493 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM1P09493 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM1P09493 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM1P09493 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM1P09493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM1P09493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM1P09493 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM1P09493 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM1P09493 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM1P09493 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM1P09493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM1P09493 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM1P09493 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM1P09493 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM1P09493 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM1P09493 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM1P09493 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM1P09493 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM1P09493 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM1P09493 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM1P09493 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM1P09493 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM1P09493 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM1P09493 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM1P09493 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM1P09493 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM1P09493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM1P09493 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM1P09493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM1P09493 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM1P09493 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM1P09493 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM1P09493 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM1P09493 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM1P09493 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM1P09493 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM1P09493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM1P09493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM1P09493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM1P09493 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM1P09493 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM1P09493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM1P09493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM1P09493 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM1P09493 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM1P09493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM1P09493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM1P09493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM1P09493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM1P09493 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM1P09493 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM1P09493 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM1P09493 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM1P09493 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM1P09493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM1P09493 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM1P09493 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM1P09493 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM1P09493 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM1P09493 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TPM1P09493 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM1P09493 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM1P09493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM1P09493 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM1P09493 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM1P09493 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM1P09493 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM1P09493 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM1P09493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM1P09493 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM1P09493 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TPM1P09493 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM1P09493 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM1P09493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM1P09493 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms