Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA4P06727 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA4P06727 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA4P06727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA4P06727 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA4P06727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA4P06727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOA4P06727 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA4P06727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA4P06727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA4P06727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA4P06727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA4P06727 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA4P06727 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA4P06727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA4P06727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA4P06727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA4P06727 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA4P06727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA4P06727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA4P06727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA4P06727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA4P06727 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA4P06727 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA4P06727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA4P06727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA4P06727 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA4P06727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA4P06727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA4P06727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA4P06727 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA4P06727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA4P06727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA4P06727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA4P06727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA4P06727 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA4P06727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA4P06727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA4P06727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA4P06727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA4P06727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA4P06727 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA4P06727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA4P06727 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA4P06727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA4P06727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA4P06727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA4P06727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA4P06727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA4P06727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA4P06727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA4P06727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA4P06727 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA4P06727 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA4P06727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA4P06727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA4P06727 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms