Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
APOA4P06727 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
APOA4P06727 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
APOA4P06727 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
APOA4P06727 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
APOA4P06727 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
APOA4P06727 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APOA4P06727 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
APOA4P06727 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
APOA4P06727 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
APOA4P06727 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
APOA4P06727 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
APOA4P06727 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
APOA4P06727 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
APOA4P06727 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
APOA4P06727 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
APOA4P06727 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOA4P06727 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOA4P06727 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
APOA4P06727 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOA4P06727 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
APOA4P06727 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOA4P06727 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOA4P06727 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOA4P06727 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOA4P06727 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
APOA4P06727 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA4P06727 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
APOA4P06727 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
APOA4P06727 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOA4P06727 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
APOA4P06727 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
APOA4P06727 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
APOA4P06727 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
APOA4P06727 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
APOA4P06727 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA4P06727 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APOA4P06727 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOA4P06727 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
APOA4P06727 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APOA4P06727 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOA4P06727 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOA4P06727 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA4P06727 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOA4P06727 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOA4P06727 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOA4P06727 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA4P06727 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOA4P06727 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOA4P06727 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOA4P06727 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOA4P06727 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOA4P06727 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOA4P06727 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOA4P06727 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOA4P06727 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOA4P06727 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
APOA4P06727 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOA4P06727 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOA4P06727 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOA4P06727 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOA4P06727 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOA4P06727 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOA4P06727 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOA4P06727 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA4P06727 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOA4P06727 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOA4P06727 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOA4P06727 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOA4P06727 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA4P06727 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOA4P06727 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOA4P06727 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA4P06727 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOA4P06727 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOA4P06727 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA4P06727 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOA4P06727 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOA4P06727 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA4P06727 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA4P06727 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA4P06727 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA4P06727 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOA4P06727 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOA4P06727 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOA4P06727 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOA4P06727 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOA4P06727 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOA4P06727 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOA4P06727 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA4P06727 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA4P06727 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA4P06727 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOA4P06727 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOA4P06727 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOA4P06727 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOA4P06727 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA4P06727 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA4P06727 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA4P06727 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms