Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3DP05423 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3DP05423 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR3DP05423 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3DP05423 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3DP05423 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms