Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTL6AO96019 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTL6AO96019 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTL6AO96019 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms