Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB36O95755 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB36O95755 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB36O95755 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB36O95755 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB36O95755 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB36O95755 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB36O95755 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB36O95755 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB36O95755 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB36O95755 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB36O95755 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB36O95755 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB36O95755 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB36O95755 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB36O95755 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB36O95755 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB36O95755 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB36O95755 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB36O95755 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB36O95755 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB36O95755 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB36O95755 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB36O95755 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB36O95755 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB36O95755 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB36O95755 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB36O95755 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB36O95755 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB36O95755 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB36O95755 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB36O95755 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB36O95755 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB36O95755 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB36O95755 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB36O95755 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB36O95755 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB36O95755 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB36O95755 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB36O95755 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB36O95755 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB36O95755 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB36O95755 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB36O95755 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB36O95755 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB36O95755 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB36O95755 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB36O95755 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB36O95755 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB36O95755 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB36O95755 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB36O95755 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB36O95755 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB36O95755 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB36O95755 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB36O95755 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB36O95755 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB36O95755 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB36O95755 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB36O95755 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms