Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNKO75909 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNKO75909 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNKO75909 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNKO75909 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNKO75909 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNKO75909 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNKO75909 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNKO75909 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNKO75909 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNKO75909 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNKO75909 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNKO75909 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNKO75909 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNKO75909 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNKO75909 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNKO75909 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNKO75909 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNKO75909 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNKO75909 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNKO75909 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNKO75909 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNKO75909 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNKO75909 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNKO75909 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNKO75909 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNKO75909 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNKO75909 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNKO75909 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNKO75909 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNKO75909 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNKO75909 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNKO75909 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNKO75909 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNKO75909 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNKO75909 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNKO75909 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNKO75909 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNKO75909 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNKO75909 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNKO75909 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNKO75909 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNKO75909 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNKO75909 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNKO75909 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNKO75909 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNKO75909 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNKO75909 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNKO75909 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNKO75909 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNKO75909 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNKO75909 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNKO75909 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNKO75909 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNKO75909 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNKO75909 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNKO75909 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNKO75909 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNKO75909 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNKO75909 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNKO75909 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNKO75909 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNKO75909 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNKO75909 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNKO75909 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNKO75909 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNKO75909 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNKO75909 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms