Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITX3O75364 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX3O75364 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX3O75364 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX3O75364 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX3O75364 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX3O75364 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX3O75364 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX3O75364 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX3O75364 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX3O75364 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX3O75364 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX3O75364 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX3O75364 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX3O75364 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX3O75364 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX3O75364 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX3O75364 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX3O75364 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX3O75364 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX3O75364 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX3O75364 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PITX3O75364 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX3O75364 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX3O75364 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX3O75364 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX3O75364 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX3O75364 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX3O75364 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX3O75364 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX3O75364 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX3O75364 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX3O75364 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX3O75364 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX3O75364 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX3O75364 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX3O75364 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX3O75364 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX3O75364 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX3O75364 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX3O75364 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX3O75364 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX3O75364 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX3O75364 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX3O75364 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX3O75364 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX3O75364 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX3O75364 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX3O75364 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX3O75364 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX3O75364 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX3O75364 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX3O75364 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX3O75364 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX3O75364 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms