Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN2O75298 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN2O75298 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN2O75298 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN2O75298 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN2O75298 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN2O75298 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN2O75298 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN2O75298 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN2O75298 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN2O75298 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN2O75298 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN2O75298 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN2O75298 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN2O75298 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN2O75298 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN2O75298 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN2O75298 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN2O75298 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN2O75298 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN2O75298 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN2O75298 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN2O75298 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN2O75298 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN2O75298 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN2O75298 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN2O75298 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN2O75298 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN2O75298 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN2O75298 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN2O75298 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN2O75298 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN2O75298 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN2O75298 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN2O75298 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN2O75298 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN2O75298 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN2O75298 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN2O75298 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN2O75298 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN2O75298 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN2O75298 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN2O75298 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN2O75298 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN2O75298 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN2O75298 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN2O75298 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN2O75298 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN2O75298 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN2O75298 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN2O75298 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN2O75298 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN2O75298 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN2O75298 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN2O75298 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN2O75298 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN2O75298 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN2O75298 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN2O75298 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN2O75298 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN2O75298 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN2O75298 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN2O75298 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN2O75298 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN2O75298 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN2O75298 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN2O75298 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN2O75298 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN2O75298 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN2O75298 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN2O75298 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RTN2O75298 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN2O75298 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN2O75298 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN2O75298 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms