Protein–RNA interactions for Protein: O43895

XPNPEP2, Xaa-Pro aminopeptidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP2O43895 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPNPEP2O43895 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPNPEP2O43895 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP2O43895 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP2O43895 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP2O43895 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPNPEP2O43895 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP2O43895 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms