Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF749O43361 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF749O43361 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF749O43361 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF749O43361 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms