Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBDO15205 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBDO15205 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBDO15205 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBDO15205 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBDO15205 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBDO15205 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBDO15205 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBDO15205 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBDO15205 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBDO15205 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBDO15205 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBDO15205 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBDO15205 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBDO15205 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBDO15205 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBDO15205 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBDO15205 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBDO15205 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBDO15205 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBDO15205 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBDO15205 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBDO15205 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBDO15205 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBDO15205 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBDO15205 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBDO15205 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBDO15205 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBDO15205 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBDO15205 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBDO15205 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBDO15205 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBDO15205 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBDO15205 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBDO15205 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBDO15205 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBDO15205 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBDO15205 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBDO15205 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBDO15205 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBDO15205 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBDO15205 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBDO15205 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBDO15205 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBDO15205 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBDO15205 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBDO15205 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBDO15205 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBDO15205 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBDO15205 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBDO15205 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBDO15205 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBDO15205 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBDO15205 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBDO15205 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBDO15205 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBDO15205 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBDO15205 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBDO15205 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBDO15205 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBDO15205 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBDO15205 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBDO15205 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBDO15205 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBDO15205 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBDO15205 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBDO15205 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBDO15205 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBDO15205 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBDO15205 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBDO15205 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBDO15205 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBDO15205 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBDO15205 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBDO15205 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBDO15205 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBDO15205 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBDO15205 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBDO15205 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBDO15205 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBDO15205 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBDO15205 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBDO15205 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBDO15205 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms