Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK3O14649 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNK3O14649 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK3O14649 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms