Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS1O00470 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS1O00470 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS1O00470 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS1O00470 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms