Protein–RNA interactions for Protein: O00444

PLK4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLK4O00444 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLK4O00444 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLK4O00444 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLK4O00444 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLK4O00444 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLK4O00444 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLK4O00444 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLK4O00444 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLK4O00444 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLK4O00444 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLK4O00444 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLK4O00444 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLK4O00444 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLK4O00444 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLK4O00444 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLK4O00444 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLK4O00444 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLK4O00444 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLK4O00444 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLK4O00444 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLK4O00444 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLK4O00444 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLK4O00444 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLK4O00444 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLK4O00444 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLK4O00444 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLK4O00444 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLK4O00444 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLK4O00444 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLK4O00444 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLK4O00444 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLK4O00444 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLK4O00444 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PLK4O00444 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLK4O00444 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLK4O00444 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLK4O00444 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLK4O00444 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLK4O00444 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLK4O00444 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLK4O00444 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLK4O00444 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLK4O00444 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLK4O00444 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLK4O00444 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLK4O00444 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLK4O00444 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLK4O00444 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLK4O00444 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLK4O00444 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLK4O00444 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLK4O00444 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLK4O00444 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLK4O00444 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLK4O00444 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLK4O00444 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PLK4O00444 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLK4O00444 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLK4O00444 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLK4O00444 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLK4O00444 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLK4O00444 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLK4O00444 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLK4O00444 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLK4O00444 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLK4O00444 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLK4O00444 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLK4O00444 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLK4O00444 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLK4O00444 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLK4O00444 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLK4O00444 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLK4O00444 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLK4O00444 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLK4O00444 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLK4O00444 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLK4O00444 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLK4O00444 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLK4O00444 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLK4O00444 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLK4O00444 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLK4O00444 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLK4O00444 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLK4O00444 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms