Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
I3L4J1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
I3L4J1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
I3L4J1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
I3L4J1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
I3L4J1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
I3L4J1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
I3L4J1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
I3L4J1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
I3L4J1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
I3L4J1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
I3L4J1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
I3L4J1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
I3L4J1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
I3L4J1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
I3L4J1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
I3L4J1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
I3L4J1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
I3L4J1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
I3L4J1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
I3L4J1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
I3L4J1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
I3L4J1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
I3L4J1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
I3L4J1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
I3L4J1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
I3L4J1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
I3L4J1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
I3L4J1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
I3L4J1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
I3L4J1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
I3L4J1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.56■■■□□ 2
I3L4J1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.56■■■□□ 2
I3L4J1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
I3L4J1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
I3L4J1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
I3L4J1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
I3L4J1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
I3L4J1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
I3L4J1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
I3L4J1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
I3L4J1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
I3L4J1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
I3L4J1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
I3L4J1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
I3L4J1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
I3L4J1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
I3L4J1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
I3L4J1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
I3L4J1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
I3L4J1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
I3L4J1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
I3L4J1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
I3L4J1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
I3L4J1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
I3L4J1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
I3L4J1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
I3L4J1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
I3L4J1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
I3L4J1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
I3L4J1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
I3L4J1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
I3L4J1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
I3L4J1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
I3L4J1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms