Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
I3L3M4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
I3L3M4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
I3L3M4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
I3L3M4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
I3L3M4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
I3L3M4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
I3L3M4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
I3L3M4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
I3L3M4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
I3L3M4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
I3L3M4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
I3L3M4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
I3L3M4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
I3L3M4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
I3L3M4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
I3L3M4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
I3L3M4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
I3L3M4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
I3L3M4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
I3L3M4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
I3L3M4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
I3L3M4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
I3L3M4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
I3L3M4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
I3L3M4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
I3L3M4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
I3L3M4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
I3L3M4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
I3L3M4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
I3L3M4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
I3L3M4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
I3L3M4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
I3L3M4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
I3L3M4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
I3L3M4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
I3L3M4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
I3L3M4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
I3L3M4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
I3L3M4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
I3L3M4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
I3L3M4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
I3L3M4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
I3L3M4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
I3L3M4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
I3L3M4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms