Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
CCDC144AA2RUR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC144AA2RUR9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC144AA2RUR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC144AA2RUR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms