Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC78A2IDD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC78A2IDD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC78A2IDD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC78A2IDD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms