Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms